4월 21일. 사츠키 호무라는 오늘도 그의 여동생 사츠키 하사미에 의해 지루한 일상 생활을 재개한다. 하지만, 최근 빈번하게 발생하는 이상 기후 현상과 자연 재해 등. 유난히 더욱 살기 흉흉해진 세상. 하지만, 오늘도 지루하고 따분한 언제나 되풀이되는 일상이 될 것이라고 그 누구도 의심하는 사람은 없었다. 하지만, 한 순간 하늘의 저편에서 떨어진 한 개의 운석. 그리고 만나게 된 한 명의 기묘한 소녀. 이윽고 차례 차례 이세계에서 건너오는 강력한 이 능력자들 의문의 소녀와 엮이게 된 호무라의 기묘한 이야기.